Флоренс выросла в обеспеченной еврейской семье германского происхождения. В юности она увлекалась гольфом и верховой ездой, любила искусство и особенно музыку. В 1884г. она вышла замуж за Дэниэла Гуггенхайма из знаменитой семьи промышленников и филантропов. У них было двое детей.
    Филантропическая деятельность Флоренс Гуггенхайм вначале концентрировалась в области музыки. В 1924г. она стала президентом Фонда Гуггенхаймов - благотворительного фонда, поддерживавшего различные художественные организации. Позже она играла активную роль в еврейских делах и в борьбе за женское равноправие. Во время Первой мировой войны она участвовала в распространении Займа Свободы. Она была также директором Национальной лиги за женскую военную службу, попечителем женской организации Конгрегации Эману-Эль в Верхнем Ист-Сайде, казначеем Национального женского республиканского клуба (1921-38).
   Флоренс и Дэниэл Гуггенхайм были известны жителям Нью-Йорка как спонсоры бесплатных концертов на открытом воздухе - в Центральном Парке, а также в Колумбийском и Нью-Йоркском университетах (вместе с Марри Гуггенхаймом и его женой). Отдавая дань глубокому интересу, который её покойный муж питал к авиации, Флоренс в 1942г. подарила своё поместье площадью 162 акра Институту аэронавтики.